Нелекуван, кариесът преминава в пулпит и периодонтит. Това означава, че инфекцията вече е достигнала до кореново-каналната система на зъба(пулпит) или вече е извън каналите, в обкръжаващата кост (периодонтит).
За отстраняването на инфекцията е необходима както механична обработка чрез специални канални инструменти, с които се премахва инфектираната тъкан, така и химична, която да дезинфектира канала.